Daftar Pusat Riset dan Inovasi di ITERA terdiri dari sebagai berikut :
- Pusat Riset dan Inovasi Perkeretaapian (Research and Innovation Center for Railway System)
- Pusat Riset dan Inovasi Ilmu Informasi Geospasial (Research and Innovation Center for Geospatial Information Science)
- Pusat Riset dan Inovasi Mitigasi Bencana danDeteksi Dini Kebakaran Hutan (Research and Innovation Center for Disaster Mitigation and Early Detection of Forest Fires)
- Pusat Riset dan Inovasi Infrastruktur Berkelanjutan (Research and Innovation Center for Sustainable Infrastructure)
- Pusat Riset dan Inovasi Kecerdasan Buatan (Research and Innovation Center for Artificial Intelligence)
- Pusat Riset dan Inovasi Lingkungan Hidup dan Sanitasi (Research and Innovation Centre for Environment and Sanitation)
- Pusat Riset dan Inovasi Teknologi Membran Nano (Research and Innovation Center for Nano Membrane Technology)
- Pusat Riset dan Inovasi Big Data (Center of Research and Innovation for Big Data)
- Pusat Riset dan Inovasi Wisata Geopark Global dan Wisata Langit (Research and Innovation Center for Global Geopark and Astro Tourism)
- Pusat Riset dan Inovasi Material Hayati dan Material Alami (Research and Innovation Center for Biological and Natural Materials)
- Pusat Riset dan Inovasi Prediksi dan Pemodelan Risiko Bahaya dan Bencana (Research and Innovation Center for Prediction and Risk Modeling on Hazard and Disaster)
- Pusat Riset dan Inovasi Material Maju (Research and Innovation Center for Advanced Materials)
- Pusat Riset dan Inovasi Teknologi Kebumian dan Mineral (Research and Innovation Center for Geoscience and Mineral Technology)
- Pusat Riset dan Inovasi Konservasi dan Energi Terbarukan (Research and Innovation Center for Conservation and Renewable Energy)